共青团中国科学院大学本科部委员会，经学校党委批准，于2018年10月成立。
本科部团委是校党委领导下的先进青年的群众组织，接受本科部、校团委的具体指导，是党联系青年学生的桥梁和纽带。本科部团委以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观为指导，深入贯彻落实习近平新时代中国特色社会主义思想，坚持不懈地用马克思主义中国化的最新成果武装全体本科生团员青年，为实现中华民族伟大复兴的中国梦注入青春活力。
本科部团委设书记、副书记、组织委员、宣传委员、科技委员各一名，下设组织部、宣传部、科创部三个部门。
本科部团委紧紧围绕“组织青年、引导青年、服务青年、维护青年合法权益”四项工作职能，立足青年学生思想引领和成长成才服务两项工作任务，结合中国科学院大学人才培养特色，在基层团组织建设、学生思想政治教育、实践育人平台建设、新媒体宣传阵地建设、科技创新支持、校园文化建设等方面取得了显著成绩，得到了全校广大团员青年的积极认可和支持，也得到了学校党委和上级团组织的充分肯定。本科部团委被评为2019年度中国科学院五四红旗团委。
本科部团委：
团委书记：刘咪稀
团委副书记：徐路路、孙骥
委员：胡勇冠、屈泽凯、王瀚一、曹莫妍
第九届本科学生会任职名单
主席团
主席：曹倍源
副主席：李家驹 温卓凡 赵方舟 张嘉楠
联络部
部长：孙明康
副部长：宁钰成 潘琦
生活权益部
部长：燕翼鸣
副部长：尚嘉辉 王家祺
社团中心
部长：曾建树
副部长：陈翼飞 陆昊 骆敏言 杨镕争 姚梓荫
体育部
部长：张誉丰
副部长：秦子茗 余健
文艺部
部长：沈菲尔
副部长：刘羽骐 刘雨珊 章宸辉
宣传中心
部长：刘迅
副部长：闵煜泽 王致力 夏扬 张雪雅
学习实践部
部长：蔡佳烨
副部长：徐文卓
本科学生社团
WINGS舞社
Avalon漫研社
指缘吉他社
尚墨轩书画社
LISTENER音乐社
瞬语摄影社
流景文学社
纵横史学社
本科合唱团
果壳良品
追梦剧社
采英国学社
乒乓球社
游泳爱好者协会
传魂武术协会
果壳排球协会
FIT健身社
果壳FC
ShuttleSmashers羽毛球社
国旗护卫队
本科篮球协会
星空志愿者协会
星火读书会
卓熠桌游社
辩论社
思源科学社
苍泣天文社
英语俱乐部
信息达人社
果壳物理社
数学社
